NCLR y el Centro Nacional de Defensores de Menores (NJDC) son miembros fundadores del Proyecto Equidad , una iniciativa nacional para garantizar el trato justo y equitativo de los jóvenes LGBTQ+ en el sistema de justicia. En 2009, el proyecto publicó su informe fundamental titulado «Injusticia Oculta», que documenta la discriminación generalizada contra los jóvenes LGBTQ+ por parte de las fuerzas del orden, los servicios de libertad condicional, los tribunales y el personal de las instituciones. Mediante capacitación, asistencia técnica y el desarrollo de políticas y estándares profesionales para las agencias, el Proyecto Equidad ha aumentado la conciencia y la competencia profesional, y ha mejorado los resultados de innumerables jóvenes LGBTQ+ involucrados en el sistema de justicia.