En enero de 2018, el Departamento de Salud y Servicios Humanos de EE. UU. (HHS) emitió una propuesta de reglamento federal que permitiría una discriminación generalizada en la prestación de atención médica en nombre de la libertad religiosa. La regla permitiría a los proveedores de atención médica negarse a tratar a alguien si su negativa se basa en una razón religiosa. NCLR presentó comentarios extensos oponiéndose a la regla, que sin embargo se emitió en forma final en mayo de 2019. Varias organizaciones y gobiernos estatales y locales demandaron al HHS para evitar que la regla entre en vigencia. NCLR presentó amicus briefs en el litigio impugnando la regla. La regla fue derogada en los tribunales. La Administración Trump apeló las órdenes que anulan la regla.